HPLC یک تکنیک برتر برای آنالیز ترکیبات آلی و معدنی کم مقدار می باشد. تعیین ترکیبات کم در داروسازی، زیست شناسی، سم شناسی و مطالعات زیست محیطی بسیار مهم است چون حتی یک ماده کم مقدار می تواند مضر یا سمی باشد. HPLC در شیمی تجزیه، دانش داروسازی و علوم بالینی کاربرد گسترده ای دارد. نقش HPLC در صنعت داروسازی بسیار جدی است. بخصوص در پیش فرمولاسیون، توسعه فرآیند ، فرمولاسیون و بررسی خلوص دارو.
در واقع HPLC بهترین تکنیک جداسازی برای آنالیز کمی مقادیر اندک از مواد شیمیایی سمی، ناخالصی ها، تولید فرآورده های با خلوص بالا، کاربردهای پزشکی و مقاصد تحقیقاتی است.